Ze względu na zastosowanie, separatory magnetyczne można podzielić na dwie grupy:
Separatory magnetyczne zgrubne przeznaczone do czyszczenia produktów sypkich z dużych zanieczyszczeń metalowych (najczęściej gwoździ, śrub, nakrętek, itp.). Stosuje się je w celu ochrony urządzeń i aparatów przed uszkodzeniem oraz wyeliminowanie potencjalnych źródeł iskier mogących dopraowadzić do pożaru lub/i wybuchu.
Separatory magnetyczne dokładne mają za zadanie oczyścić produkt z niewielkich drobin jak rdza lub opiłki metalu. Separatory tego typu stosuje się m.in. przed procesami wrażliwymi na obecność zanieczyszczeń lub w liniach pakowania gotowych produktów (m.in. przemysł spożywczy, farmaceutyczny, chemiczny).
Separatory magnetyczne określane są również jako: separatory metali, oddzielacze metali, oddzielacze magnetyczne lub magnesy przemysłowe.